Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms