Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms