Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms