Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms