Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms