Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms