Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Sec23aQ01405 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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