Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms