Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms