Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms