Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lama4P97927 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lama4P97927 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lama4P97927 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lama4P97927 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lama4P97927 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lama4P97927 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lama4P97927 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lama4P97927 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms