Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad50P70388 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad50P70388 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad50P70388 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Rad50P70388 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad50P70388 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad50P70388 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad50P70388 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms