Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta1P68134 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms