Protein–RNA interactions for Protein: P62838

Ube2d2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d2P62838 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms