Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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