Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snrpd1P62315 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms