Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp46P62069 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp46P62069 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp46P62069 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp46P62069 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp46P62069 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp46P62069 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp46P62069 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms