Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ufm1P61961 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms