Protein–RNA interactions for Protein: P61089

Ube2n, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2nP61089 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2nP61089 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2nP61089 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2nP61089 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2nP61089 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2nP61089 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2nP61089 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2nP61089 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2nP61089 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2nP61089 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2nP61089 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2nP61089 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2nP61089 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2nP61089 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2nP61089 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2nP61089 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2nP61089 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2nP61089 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2nP61089 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2nP61089 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2nP61089 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2nP61089 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2nP61089 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2nP61089 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2nP61089 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2nP61089 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2nP61089 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2nP61089 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2nP61089 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2nP61089 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2nP61089 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2nP61089 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2nP61089 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2nP61089 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2nP61089 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2nP61089 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2nP61089 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2nP61089 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2nP61089 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2nP61089 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2nP61089 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2nP61089 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2nP61089 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2nP61089 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms