Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms