Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrpa1P57784 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms