Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp25P57080 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp25P57080 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp25P57080 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp25P57080 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp25P57080 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp25P57080 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms