Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf5P56477 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf5P56477 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irf5P56477 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Irf5P56477 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf5P56477 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Irf5P56477 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Irf5P56477 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Irf5P56477 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Irf5P56477 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Irf5P56477 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Irf5P56477 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Irf5P56477 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Irf5P56477 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Irf5P56477 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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Irf5P56477 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Irf5P56477 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf5P56477 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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