Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CartptP56388 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CartptP56388 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CartptP56388 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CartptP56388 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CartptP56388 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CartptP56388 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CartptP56388 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CartptP56388 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CartptP56388 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CartptP56388 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CartptP56388 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CartptP56388 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CartptP56388 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CartptP56388 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CartptP56388 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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CartptP56388 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CartptP56388 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CartptP56388 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CartptP56388 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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CartptP56388 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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CartptP56388 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CartptP56388 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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CartptP56388 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CartptP56388 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CartptP56388 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CartptP56388 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CartptP56388 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CartptP56388 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CartptP56388 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CartptP56388 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CartptP56388 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CartptP56388 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CartptP56388 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CartptP56388 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CartptP56388 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CartptP56388 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CartptP56388 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CartptP56388 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CartptP56388 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CartptP56388 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CartptP56388 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CartptP56388 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CartptP56388 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CartptP56388 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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CartptP56388 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CartptP56388 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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CartptP56388 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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CartptP56388 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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CartptP56388 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CartptP56388 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CartptP56388 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CartptP56388 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CartptP56388 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CartptP56388 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CartptP56388 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CartptP56388 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CartptP56388 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CartptP56388 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CartptP56388 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CartptP56388 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CartptP56388 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CartptP56388 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CartptP56388 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CartptP56388 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CartptP56388 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CartptP56388 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CartptP56388 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CartptP56388 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CartptP56388 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CartptP56388 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CartptP56388 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CartptP56388 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CartptP56388 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CartptP56388 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms