Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms