Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pex2P55098 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pex2P55098 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pex2P55098 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pex2P55098 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pex2P55098 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pex2P55098 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pex2P55098 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pex2P55098 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pex2P55098 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pex2P55098 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pex2P55098 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms