Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms