Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
FmodP50608 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
FmodP50608 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
FmodP50608 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
FmodP50608 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
FmodP50608 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
FmodP50608 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
FmodP50608 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
FmodP50608 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
FmodP50608 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
FmodP50608 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
FmodP50608 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
FmodP50608 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
FmodP50608 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
FmodP50608 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
FmodP50608 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
FmodP50608 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
FmodP50608 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
FmodP50608 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
FmodP50608 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
FmodP50608 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
FmodP50608 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
FmodP50608 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
FmodP50608 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
FmodP50608 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
FmodP50608 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
FmodP50608 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
FmodP50608 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
FmodP50608 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
FmodP50608 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
FmodP50608 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
FmodP50608 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
FmodP50608 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
FmodP50608 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
FmodP50608 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
FmodP50608 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
FmodP50608 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
FmodP50608 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
FmodP50608 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
FmodP50608 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
FmodP50608 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
FmodP50608 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
FmodP50608 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
FmodP50608 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
FmodP50608 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
FmodP50608 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
FmodP50608 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
FmodP50608 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
FmodP50608 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
FmodP50608 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
FmodP50608 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
FmodP50608 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
FmodP50608 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
FmodP50608 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
FmodP50608 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
FmodP50608 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
FmodP50608 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
FmodP50608 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
FmodP50608 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
FmodP50608 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
FmodP50608 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
FmodP50608 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
FmodP50608 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
FmodP50608 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
FmodP50608 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
FmodP50608 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
FmodP50608 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
FmodP50608 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
FmodP50608 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
FmodP50608 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
FmodP50608 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
FmodP50608 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
FmodP50608 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
FmodP50608 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
FmodP50608 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
FmodP50608 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
FmodP50608 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
FmodP50608 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
FmodP50608 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
FmodP50608 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
FmodP50608 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
FmodP50608 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
FmodP50608 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
FmodP50608 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
FmodP50608 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
FmodP50608 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
FmodP50608 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
FmodP50608 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
FmodP50608 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
FmodP50608 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
FmodP50608 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
FmodP50608 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
FmodP50608 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
FmodP50608 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
FmodP50608 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
FmodP50608 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
FmodP50608 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
FmodP50608 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
FmodP50608 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
FmodP50608 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms