Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms