Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrprbP47758 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrprbP47758 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SrprbP47758 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SrprbP47758 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrprbP47758 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrprbP47758 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrprbP47758 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrprbP47758 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrprbP47758 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrprbP47758 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrprbP47758 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms