Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms