Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ItgavP43406 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ItgavP43406 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ItgavP43406 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ItgavP43406 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ItgavP43406 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ItgavP43406 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ItgavP43406 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms