Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lig1P37913 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lig1P37913 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lig1P37913 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lig1P37913 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lig1P37913 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lig1P37913 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lig1P37913 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Lig1P37913 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lig1P37913 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lig1P37913 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lig1P37913 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lig1P37913 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lig1P37913 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lig1P37913 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lig1P37913 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lig1P37913 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lig1P37913 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lig1P37913 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lig1P37913 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lig1P37913 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lig1P37913 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lig1P37913 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lig1P37913 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lig1P37913 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lig1P37913 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lig1P37913 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lig1P37913 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lig1P37913 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lig1P37913 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lig1P37913 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lig1P37913 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lig1P37913 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lig1P37913 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lig1P37913 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Lig1P37913 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lig1P37913 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lig1P37913 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lig1P37913 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lig1P37913 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lig1P37913 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lig1P37913 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lig1P37913 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Lig1P37913 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lig1P37913 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lig1P37913 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lig1P37913 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lig1P37913 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lig1P37913 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lig1P37913 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lig1P37913 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lig1P37913 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lig1P37913 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lig1P37913 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lig1P37913 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lig1P37913 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lig1P37913 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lig1P37913 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lig1P37913 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lig1P37913 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lig1P37913 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lig1P37913 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lig1P37913 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lig1P37913 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lig1P37913 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lig1P37913 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lig1P37913 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lig1P37913 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lig1P37913 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Lig1P37913 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lig1P37913 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lig1P37913 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lig1P37913 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lig1P37913 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lig1P37913 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lig1P37913 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lig1P37913 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lig1P37913 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Lig1P37913 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lig1P37913 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lig1P37913 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lig1P37913 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Lig1P37913 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lig1P37913 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lig1P37913 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lig1P37913 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lig1P37913 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lig1P37913 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Lig1P37913 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lig1P37913 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lig1P37913 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lig1P37913 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lig1P37913 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lig1P37913 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lig1P37913 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lig1P37913 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lig1P37913 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lig1P37913 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lig1P37913 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lig1P37913 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms