Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprmP28828 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprmP28828 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprmP28828 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprmP28828 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprmP28828 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprmP28828 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprmP28828 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprmP28828 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtprmP28828 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprmP28828 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprmP28828 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprmP28828 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprmP28828 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
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