Protein–RNA interactions for Protein: P23440

Pde6b, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6bP23440 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Pde6bP23440 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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