Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkchP23298 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkchP23298 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkchP23298 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkchP23298 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkchP23298 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkchP23298 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkchP23298 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms