Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
NelfeP19426 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NelfeP19426 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
NelfeP19426 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NelfeP19426 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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