Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18530 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18530 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18530 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18530 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18530 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18530 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18530 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18530 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18530 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18530 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18530 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18530 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18530 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18530 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18530 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18530 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18530 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18530 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18530 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18530 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18530 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18530 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18530 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18530 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18530 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18530 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18530 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18530 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18530 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18530 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18530 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18530 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18530 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18530 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18530 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18530 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18530 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P18530 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P18530 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P18530 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P18530 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18530 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18530 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P18530 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18530 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18530 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18530 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P18530 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18530 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18530 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18530 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18530 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18530 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18530 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18530 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18530 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18530 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18530 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18530 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18530 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18530 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P18530 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18530 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18530 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18530 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18530 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18530 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18530 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18530 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18530 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18530 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18530 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P18530 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P18530 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18530 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18530 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18530 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18530 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18530 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P18530 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18530 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18530 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18530 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18530 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18530 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18530 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18530 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18530 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18530 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18530 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P18530 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18530 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18530 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18530 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18530 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18530 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18530 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18530 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18530 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms