Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PcnaP17918 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PcnaP17918 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PcnaP17918 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PcnaP17918 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcnaP17918 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PcnaP17918 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PcnaP17918 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PcnaP17918 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PcnaP17918 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms