Protein–RNA interactions for Protein: P13346

Fosb, Protein fosB, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosbP13346 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FosbP13346 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FosbP13346 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FosbP13346 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FosbP13346 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FosbP13346 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FosbP13346 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FosbP13346 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FosbP13346 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FosbP13346 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FosbP13346 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FosbP13346 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FosbP13346 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FosbP13346 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FosbP13346 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FosbP13346 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FosbP13346 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FosbP13346 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FosbP13346 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FosbP13346 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FosbP13346 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FosbP13346 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FosbP13346 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FosbP13346 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FosbP13346 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FosbP13346 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FosbP13346 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FosbP13346 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FosbP13346 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FosbP13346 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FosbP13346 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FosbP13346 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FosbP13346 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FosbP13346 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FosbP13346 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FosbP13346 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FosbP13346 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FosbP13346 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FosbP13346 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FosbP13346 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FosbP13346 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FosbP13346 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FosbP13346 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FosbP13346 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FosbP13346 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FosbP13346 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FosbP13346 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FosbP13346 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FosbP13346 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FosbP13346 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FosbP13346 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FosbP13346 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FosbP13346 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FosbP13346 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FosbP13346 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FosbP13346 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FosbP13346 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FosbP13346 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FosbP13346 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FosbP13346 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FosbP13346 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FosbP13346 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FosbP13346 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FosbP13346 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FosbP13346 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FosbP13346 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FosbP13346 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FosbP13346 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FosbP13346 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FosbP13346 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FosbP13346 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FosbP13346 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FosbP13346 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FosbP13346 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FosbP13346 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FosbP13346 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FosbP13346 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FosbP13346 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FosbP13346 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FosbP13346 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FosbP13346 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FosbP13346 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FosbP13346 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FosbP13346 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FosbP13346 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FosbP13346 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FosbP13346 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FosbP13346 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FosbP13346 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FosbP13346 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FosbP13346 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FosbP13346 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FosbP13346 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FosbP13346 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FosbP13346 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FosbP13346 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FosbP13346 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FosbP13346 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FosbP13346 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FosbP13346 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms