Protein–RNA interactions for Protein: P12246

Apcs, Serum amyloid P-component, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApcsP12246 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApcsP12246 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
ApcsP12246 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApcsP12246 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
ApcsP12246 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
ApcsP12246 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApcsP12246 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApcsP12246 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApcsP12246 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApcsP12246 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApcsP12246 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
ApcsP12246 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApcsP12246 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms