Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prf1P10820 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prf1P10820 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prf1P10820 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prf1P10820 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prf1P10820 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prf1P10820 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prf1P10820 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prf1P10820 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prf1P10820 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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