Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TtrP07309 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TtrP07309 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TtrP07309 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TtrP07309 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TtrP07309 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TtrP07309 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TtrP07309 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TtrP07309 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TtrP07309 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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TtrP07309 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TtrP07309 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TtrP07309 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TtrP07309 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TtrP07309 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TtrP07309 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TtrP07309 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TtrP07309 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TtrP07309 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TtrP07309 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TtrP07309 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TtrP07309 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TtrP07309 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
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TtrP07309 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
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TtrP07309 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
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TtrP07309 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
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TtrP07309 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TtrP07309 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TtrP07309 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
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TtrP07309 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TtrP07309 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TtrP07309 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
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TtrP07309 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TtrP07309 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TtrP07309 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TtrP07309 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TtrP07309 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TtrP07309 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TtrP07309 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
TtrP07309 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TtrP07309 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
TtrP07309 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TtrP07309 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TtrP07309 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TtrP07309 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TtrP07309 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
TtrP07309 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
TtrP07309 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TtrP07309 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TtrP07309 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TtrP07309 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
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