Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P04212 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P04212 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P04212 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P04212 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P04212 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P04212 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P04212 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P04212 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P04212 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P04212 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P04212 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P04212 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P04212 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P04212 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P04212 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P04212 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P04212 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P04212 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P04212 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P04212 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P04212 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P04212 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P04212 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P04212 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P04212 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P04212 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P04212 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P04212 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P04212 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P04212 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P04212 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P04212 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P04212 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P04212 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P04212 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P04212 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P04212 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P04212 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P04212 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P04212 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P04212 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P04212 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P04212 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P04212 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P04212 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P04212 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P04212 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P04212 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P04212 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P04212 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P04212 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P04212 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P04212 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P04212 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P04212 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P04212 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P04212 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P04212 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P04212 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P04212 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P04212 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P04212 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P04212 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P04212 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P04212 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P04212 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P04212 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P04212 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P04212 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P04212 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P04212 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P04212 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P04212 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P04212 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P04212 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P04212 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P04212 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P04212 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P04212 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P04212 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P04212 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P04212 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P04212 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P04212 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P04212 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P04212 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P04212 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P04212 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P04212 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P04212 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
P04212 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
P04212 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
P04212 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
P04212 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
P04212 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
P04212 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
P04212 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P04212 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P04212 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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