Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01641 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01641 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01641 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01641 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01641 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01641 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01641 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01641 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01641 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
P01641 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01641 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
P01641 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01641 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01641 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01641 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01641 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01641 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01641 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01641 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01641 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01641 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01641 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01641 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01641 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P01641 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01641 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01641 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01641 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01641 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01641 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01641 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01641 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01641 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01641 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01641 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01641 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01641 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01641 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01641 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01641 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
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P01641 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01641 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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P01641 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01641 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01641 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01641 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01641 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01641 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01641 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01641 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01641 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01641 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01641 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01641 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P01641 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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P01641 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P01641 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P01641 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
P01641 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P01641 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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P01641 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P01641 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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P01641 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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P01641 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P01641 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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P01641 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P01641 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
P01641 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
P01641 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
P01641 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
P01641 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
P01641 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P01641 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P01641 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P01641 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P01641 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P01641 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
P01641 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
P01641 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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