Protein–RNA interactions for Protein: O88253

Gm10226, Mszf39 (Fragment), mousemouse

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10226O88253 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Gm10226O88253 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Gm10226O88253 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Gm10226O88253 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Gm10226O88253 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Gm10226O88253 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Gm10226O88253 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Gm10226O88253 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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