Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stra6O70491 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stra6O70491 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Stra6O70491 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stra6O70491 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stra6O70491 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stra6O70491 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stra6O70491 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Stra6O70491 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stra6O70491 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Stra6O70491 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Stra6O70491 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Stra6O70491 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Stra6O70491 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stra6O70491 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Stra6O70491 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Stra6O70491 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Stra6O70491 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stra6O70491 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stra6O70491 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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