Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

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Length 585 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TsksO54887 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TsksO54887 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TsksO54887 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TsksO54887 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TsksO54887 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TsksO54887 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TsksO54887 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TsksO54887 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TsksO54887 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TsksO54887 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TsksO54887 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TsksO54887 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TsksO54887 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TsksO54887 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TsksO54887 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TsksO54887 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TsksO54887 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TsksO54887 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TsksO54887 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TsksO54887 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TsksO54887 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TsksO54887 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TsksO54887 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TsksO54887 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TsksO54887 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TsksO54887 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TsksO54887 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TsksO54887 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TsksO54887 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TsksO54887 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TsksO54887 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TsksO54887 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TsksO54887 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TsksO54887 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TsksO54887 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TsksO54887 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TsksO54887 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TsksO54887 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TsksO54887 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TsksO54887 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TsksO54887 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TsksO54887 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TsksO54887 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TsksO54887 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TsksO54887 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TsksO54887 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TsksO54887 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TsksO54887 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TsksO54887 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TsksO54887 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TsksO54887 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TsksO54887 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TsksO54887 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TsksO54887 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TsksO54887 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TsksO54887 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TsksO54887 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TsksO54887 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TsksO54887 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TsksO54887 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TsksO54887 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TsksO54887 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TsksO54887 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TsksO54887 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TsksO54887 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TsksO54887 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TsksO54887 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TsksO54887 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TsksO54887 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TsksO54887 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TsksO54887 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TsksO54887 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TsksO54887 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TsksO54887 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TsksO54887 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TsksO54887 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TsksO54887 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TsksO54887 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TsksO54887 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TsksO54887 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TsksO54887 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TsksO54887 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TsksO54887 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TsksO54887 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TsksO54887 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TsksO54887 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TsksO54887 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TsksO54887 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TsksO54887 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TsksO54887 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TsksO54887 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TsksO54887 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TsksO54887 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TsksO54887 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TsksO54887 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TsksO54887 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TsksO54887 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TsksO54887 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TsksO54887 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms