Protein–RNA interactions for Protein: O54818

Tpd52l1, Tumor protein D53, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52l1O54818 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpd52l1O54818 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms