Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrxO54751 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrxO54751 5033428I22Rik-204ENSMUST00000210633 6652 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrxO54751 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrxO54751 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
CrxO54751 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
CrxO54751 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrxO54751 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrxO54751 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrxO54751 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrxO54751 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrxO54751 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrxO54751 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrxO54751 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrxO54751 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrxO54751 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrxO54751 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrxO54751 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrxO54751 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrxO54751 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrxO54751 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
CrxO54751 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrxO54751 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrxO54751 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrxO54751 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
CrxO54751 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrxO54751 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrxO54751 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrxO54751 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrxO54751 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
CrxO54751 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrxO54751 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrxO54751 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrxO54751 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrxO54751 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrxO54751 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrxO54751 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrxO54751 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrxO54751 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrxO54751 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrxO54751 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrxO54751 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrxO54751 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrxO54751 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrxO54751 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrxO54751 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrxO54751 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrxO54751 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrxO54751 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrxO54751 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrxO54751 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrxO54751 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrxO54751 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrxO54751 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrxO54751 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrxO54751 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrxO54751 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrxO54751 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrxO54751 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrxO54751 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrxO54751 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrxO54751 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrxO54751 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrxO54751 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrxO54751 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrxO54751 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrxO54751 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrxO54751 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrxO54751 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrxO54751 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrxO54751 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrxO54751 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrxO54751 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrxO54751 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrxO54751 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrxO54751 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
CrxO54751 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrxO54751 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrxO54751 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrxO54751 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
CrxO54751 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrxO54751 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrxO54751 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
CrxO54751 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrxO54751 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
CrxO54751 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrxO54751 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
CrxO54751 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrxO54751 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrxO54751 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrxO54751 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrxO54751 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrxO54751 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrxO54751 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrxO54751 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrxO54751 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrxO54751 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrxO54751 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrxO54751 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrxO54751 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms